重大，伊犁将军一职颇受清廷重视，一般均由满族亲贵和蒙古重臣担任。如保宁、松筠、长龄、庆祥、扎拉芬泰、广福等都是蒙古八旗贵族；奕山出自皇家宗室；志税属外戚，系光绪皇帝珍妃、瑾妃之兄。伊犁将军由皇上直接任命，尤其是最初几任，不是“椒室懿亲”，就是参加清朝统一西域战争的将领，他们地位显赫，在新疆开创之际发挥过重要作用，如明瑞、阿桂、舒赫德、永贵等。由于新疆无总督巡抚之设，故事权专一。这要求将军指挥军事之外，兼理民政，所以伊犁将军皆被清廷认为才优干济之人。伊犁将军一般任期不长，多者数年，少则数月。如果需要，可一人数任，也可因事更换，所以调动频繁。曾任伊犁将军的满蒙大员，后来出任朝廷军机大臣、宰辅等职而成为清代重臣的不乏其人，如舒赫德、永贵、明亮、松筠、玉麟、阿桂、长龄等。另外，在新疆亡故的将军有伊勒图、德英阿、扎拉芬泰、锡伦、色楞额、明绪、常清、广福、志锐等9人。
    在伊犁颇有建树、影响较大的伊犁将军有明瑞、阿桂、松筠、长龄、奕山、布彦泰、金顺、长庚、马亮等。首任伊犁将军明瑞，任职近5年，是伊犁将军府体制开创时期，任内修建了著名的伊犁九城中的惠远、宁远、惠宁、塔勒奇等城池，组建了厄鲁特营、察哈尔营、锡伯营和索伦营。从此，“西域大地劲旅棋布，城廓星罗，宣国威于边疆，开一代之胜举”。第二任伊犁将军阿桂，早在伊犁初建时期，就以办事大臣身份来到伊犁，协助明瑞平定了大、小和卓之叛乱，并在他主持下，从南疆迁移维吾尔族居民来伊犁屯田及率领绿营汉族军队屯田，使昔日荒凉的伊犁河谷变成到处是良田炊烟、鸡鸣畜叫的塞外粮仓，对于恢复和发展边陲地区的生产、稳定和社会秩序，功不可没。他出任伊犁将军后，继续完成伊犁九城的兴建，使之成为伊犁军民守卫西北边疆的主要据点。伊犁“如内地，数千里安然”，出现前所未有的社会安定、繁荣景象，对开发伊犁、保卫伊犁立下了汗马功勋。松筠，是一位富有传奇色彩的人物，他历仕三朝，久历边疆，前后两次出任伊犁将军，他在伊犁修水利、兴旗屯，对边疆的长治久安作出了积极的贡献。松筠礼贤下士，不拘一格选人才。当时谪戍伊犁的大学士祁韵士、徐松等，就是在他的支持下，写下了大量有关边疆史地的不朽之作的。松筠还主持编修了《西陲总统事略》、《钦定新疆识略》等典籍。奕山，任内制定伊犁变通禁烟章程五条，查办种植、吸食、贩卖鸦片人犯；开垦塔什图毕荒地16万余亩，安置回民千户，对维护社会稳定和农垦开发起过重要作用。在历任伊犁将军中，布彦泰也是一位较重要的人物。他出任伊犁将军正值中英鸦片战争爆发，随后清帝开始走向衰退。他熟悉边情，了解下层生活，其在伊犁的主要功绩：奏驳伊犁总兵移设天津；开垦惠远三棵树、阿勒卜斯等处荒地20余万亩，给无地农民耕种；集资扩建伊犁河阿齐乌苏大渠，引喀什河水，灌田数万亩，为边疆各族人民安居乐业作出积极贡献。长龄则亲自率军平定了张格尔之乱，在两次西征平乱中指挥若定，善后布置驻兵有章可法，颇具才能。金顺在从沙俄手中收回伊犁时发挥了作用。进驻伊犁后，重修惠远等城，恢复锡伯、察哈尔等营制，召民屯田生产，设置卡伦台站，为伊犁的重建和恢复作出不懈努力。马亮在任内曾大力整修塔勒奇（今果子沟）通道，为改善伊犁至内地的交通，做了许多实际工作。长庚是在内外危机四起的清代末期出任伊犁将军的，面对沙俄威胁，他练兵图强，操练新军，创办新式学堂，选派留学生，引进西方先进技术，举办近代工业，开办电灯、电话，并积极恢复伊犁河谷的屯田，促进了伊犁的经济发展。